※ 글쓴이는 취미로 코딩을 익혀보는 사람이라 정확하지 않은 내용을 담고 있을 수 있다 ※
이번에 볼 문제는 백준 1969번 문제인 DNA이다.
문제는 아래 링크를 확인하자.
https://www.acmicpc.net/problem/1969
1969번: DNA
DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오
www.acmicpc.net
해밍 거리(Hamming Distance)는 길이가 같은 두 문자열에 대하여 순서대로 각 문자를 대응시킬 때, 서로 다른 문자가 대응된 개수를 의미한다. 이는 가장 간단한 편집거리(Edit Distance) 중 하나이기도 하다.
주어지는 문자열들의 각 i번째 문자는 다른 순서의 문자와 대응될 일이 없으므로, 각 순서에 대하여 가장 많이 등장한 문자를 새로 만드는 문자열의 문자로 선택하는 것이 항상 최선임을 알 수 있다. 그러한 문자가 여럿 있을 경우, 사전순으로 가장 빠른 문자열을 만들어야하므로 A, C, G, T 순으로 고르도록 하자.
아래는 제출한 소스코드이다.
#include <iostream>
#include <string>
using namespace std;
int cnt[50][4];
int main() {
ios::sync_with_stdio(0);
cin.tie(0);
int N, M; cin >> N >> M;
for (int n = 0; n < N; n++) {
string s; cin >> s;
for (int i = 0; i < M; i++) {
if (s[i] == 'A') cnt[i][0]++;
else if (s[i] == 'C') cnt[i][1]++;
else if (s[i] == 'G') cnt[i][2]++;
else cnt[i][3]++;
}
}
int dist = 0;
for (int i = 0; i < M; i++) {
int x = (cnt[i][0] >= cnt[i][1]) ? 0 : 1;
int y = (cnt[i][2] >= cnt[i][3]) ? 2 : 3;
int idx = (cnt[i][x] >= cnt[i][y]) ? x : y;
dist += cnt[i][idx];
if (idx == 0) cout << 'A';
else if (idx == 1) cout << 'C';
else if (idx == 2) cout << 'G';
else cout << 'T';
}
cout << '\n' << N * M - dist;
}
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